Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPAP2Q8IXW5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms