Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LINC00173Q6ZV60 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms