Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms