Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VSTM1Q6UX27 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms