Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A47Q6Q0C1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms