Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6P435 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6P435 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6P435 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6P435 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6P435 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6P435 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6P435 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6P435 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6P435 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6P435 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6P435 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6P435 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6P435 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6P435 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6P435 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6P435 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms