Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC178Q5BJE1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms