Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SP6Q3SY56 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SP6Q3SY56 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms