Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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