Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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SGCAQ16586 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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