Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F4Q16254 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2F4Q16254 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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