Protein–RNA interactions for Protein: Q15782

CHI3L2, Chitinase-3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L2Q15782 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHI3L2Q15782 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L2Q15782 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms