Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SS18Q15532 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SS18Q15532 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SS18Q15532 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SS18Q15532 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SS18Q15532 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SS18Q15532 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SS18Q15532 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SS18Q15532 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SS18Q15532 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms