Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCOLCEQ15113 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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