Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR1D2Q14995 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR1D2Q14995 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms