Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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