Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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