Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERV3-1Q14264 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERV3-1Q14264 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms