Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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VGLL4Q14135 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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VGLL4Q14135 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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VGLL4Q14135 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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VGLL4Q14135 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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VGLL4Q14135 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VGLL4Q14135 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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