Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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COL9A2Q14055 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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COL9A2Q14055 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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COL9A2Q14055 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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COL9A2Q14055 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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COL9A2Q14055 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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COL9A2Q14055 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COL9A2Q14055 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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