Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TUBA3CQ13748 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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