Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCGB2A2Q13296 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCGB2A2Q13296 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms