Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3FQ13275 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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