Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GRIN2BQ13224 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GRIN2BQ13224 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
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