Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ERCC8Q13216 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms