Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMD2Q13200 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms