Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
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NR1H3Q13133 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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NR1H3Q13133 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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NR1H3Q13133 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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