Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPN13Q12923 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN13Q12923 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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