Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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