Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBRQ0VD83 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms