Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms