Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms