Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DEUP1Q05D60 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms