Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms