Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms