Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLOD1Q02809 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms