Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SKP1P63208 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKP1P63208 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms