Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P61574 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P61574 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms