Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVS71-1P61550 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms