Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCE1P61221 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms