Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN2P57739 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN2P57739 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms