Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIK1P57059 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIK1P57059 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIK1P57059 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIK1P57059 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SIK1P57059 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIK1P57059 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIK1P57059 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIK1P57059 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIK1P57059 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIK1P57059 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIK1P57059 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIK1P57059 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIK1P57059 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIK1P57059 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIK1P57059 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms