Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MRE11P49959 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MRE11P49959 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MRE11P49959 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
MRE11P49959 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MRE11P49959 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MRE11P49959 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MRE11P49959 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MRE11P49959 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms