Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TAF6P49848 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF6P49848 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF6P49848 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF6P49848 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF6P49848 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF6P49848 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF6P49848 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF6P49848 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF6P49848 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF6P49848 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF6P49848 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF6P49848 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF6P49848 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF6P49848 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF6P49848 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms