Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTGER3P43115 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGER3P43115 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms