Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms