Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms