Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms