Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms