Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms